Cellenion新品釋放單細胞蛋白質組學的潛力
【字體: 大 中 小 】 時間:2022年12月07日 來源:生物通
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proteoCHIP LF 48是Cellenion公司推出的一種適用于無標記單細胞蛋白質組學分析的樣品制備的方案,憑借cellenONE®單細胞分離平臺,每個proteoCHIP可制備分離48個單細胞,每次運行可制備144個單細胞,適用于后續無標記的單細胞質譜分析。
正常組織或者疾病/腫瘤組織里的細胞也像大廠員工一樣,雖然個個看來相似卻各司其職,發揮不同作用。批量、均一化分析是無法參透其中運作機制和關鍵崗位的具體作用的,需要逐個“偵查”研究才能找出那些導致整體破壞的“變異”和“腐敗鏈”。單細胞分析的重要性已經毋庸置疑。
以10x Genomic為代表,利用各種序列Barcode參入標記、聯合高通量測序帶來技術上的飛躍,成功實現對組織中成千上萬個單細胞進行單細胞轉錄組分析,使單細胞分析越來越接近“真相”。然而,細胞功能的主要執行者始終是蛋白質,真核細胞在轉錄后還有豐富的轉錄本剪接、轉錄后調控、翻譯修飾等調控手段,很多都是轉錄組分析難以真實反應的。
釋放單細胞蛋白質組學的潛力
基于質譜(MS)的蛋白質組學對單細胞的深入表征能推動生物過程的新發現,促使更好地理解疾病機制,揭開被群體批量分析所掩蓋的細胞機制。MALDI、ESI、ICP和SIMS等離子源已經在代謝組學、蛋白質組學、離子組學、金屬組學和脂質組學等領域證明了其在單細胞分析中的潛力。但是,單細胞質譜方法的應用依然受單細胞樣品制備的限制——缺乏完整的自動化解決方案,繁瑣的人工處理步驟還會導致整個過程中的重要肽的損失。樣品制備流程的改進將加快釋放單細胞蛋白質組學的潛力。
proteoCHIP LF 48是Cellenion公司推出的一種適用于無標記單細胞蛋白質組學分析的樣品制備的方案,憑借cellenONE®單細胞分離平臺,每個proteoCHIP可制備分離48個單細胞,每次運行可制備144個單細胞,適用于后續無標記的單細胞質譜分析。
cellenONE®平臺基于圖像分離單細胞,確保只分離出感興趣的單個細胞,并且經過分離得到的單細胞狀態還是棒棒噠——保留了細胞活力和基因表達。其實簡潔說,原理很簡單,就是一臺精確的超微量試劑分配(微微升/picoliter到納升/nanoliter)再加顯微鏡——細胞懸液裝入玻璃毛細管,毛細管尖端置于顯微鏡前,尖端的分配區(看圖,綠線以下)對應每次分配液滴體積,記錄圖像,根據用戶定義多參數進行判斷分選,若包含符合要求的單細胞則通過溫和的壓電聲學致動液滴分配到指定區域,其他情況如死細胞、碎片、空白、兩個/多個細胞則分配到回收瓶以供回收重處理?磮D!一圖解百惑。
這個看起來運行通量不算高、沒有流式高效?嗯,不過,要做無標記的單細胞蛋白質組分析(抗體標記可能導致細胞發生變化),要分離得到的細胞保留細胞活力和基因表達、或者繼續培養細胞建系,cellenONE可以,流式并不適合。cellenONE系統的主要優勢在于能基于熒光或明場圖像進行分選,能夠自定義排序參數(形態/熒光),高達100%單細胞/孔精度(無雙細胞,無空孔,無碎片),每個細胞可以查看圖像記錄,方便將表型/形態學信息和組學數據關聯,適合細胞數量稀少的分析以及稀有細胞分析。另外cellenONE可以集成II級生物安全柜,為樣本制備提供即時視覺反饋,能回收沒被選中的細胞進行再處理,盡可能保護珍貴樣本。
proteoCHIP LF 48就是在cellenONE平臺上為單細胞質譜分析而開發的自動化完整解決方案,能夠以無標簽的方式實現單個細胞微量化樣品制備,以便后繼單細胞質譜分析。它能夠借助顯微鏡圖像、根據大小/形狀/熒光信號等多種參數來選擇和分離感興趣的細胞,每個proteoCHIP有48孔,cellenONE®可同時運行3張芯片,即每次運行可制備144個單細胞。細胞分離后芯片可以直接連接到 LC-MS/MS系統的自動進樣器或手動轉移到相關容器(例如Evotips)中,大量減少人工處理步驟和污染問題。
你看,雖然原理簡單,運行通量也不特別高,但能解決研究中的一個痛點,打開一個限速步驟,就能加快整個探索的步伐,正可謂“無論是一大步還是一小步,都是推動世界前進的腳步!