10x Genomics新品同時分析單細胞轉錄組和表觀基因組
【字體: 大 中 小 】 時間:2020年09月22日 來源:生物通
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10x Genomics公司近日宣布正式發售Chromium單細胞多組學ATAC + 基因表達解決方案,該產品能夠同時對同一單細胞開展表觀基因組和轉錄組分析。
10x Genomics公司近日宣布正式發售Chromium單細胞多組學ATAC + 基因表達解決方案,該產品能夠同時對同一單細胞開展表觀基因組和轉錄組分析。通過這種多組學方法,研究人員可以將細胞的表觀遺傳程序與轉錄圖譜相關聯,從而更好地了解細胞功能。
Chromium單細胞多組學ATAC + 基因表達解決方案帶來了細胞的基因表達譜及其表觀基因組景觀的一體化視圖。它同時采用兩種模式,能夠提高細胞狀態的分辨率,鑒定差異基因表達的驅動因素,并發現轉錄圖譜相似但染色質景觀功能不同的細胞。
據介紹,這種多組學分析有助于了解腫瘤異質性的驅動因素、治療耐藥的機制以及與神經退行性或免疫性疾病相關的細胞類型。
這個新的解決方案是基于10x Genomics今年推出的一系列新產品,包括適用于單細胞分析的Chromium平臺以及適用于空間基因組學的Visium平臺。目前已有多名客戶試用了Chromium單細胞多組學ATAC + 基因表達,包括斯坦福大學醫學院、西奈山伊坎醫學院和西班牙國家基因組分析中心。
斯坦福大學醫學院的病理學助理教授Ansuman Satpathy博士表示:“我的實驗室很想了解為什么有些免疫細胞無法對抗癌癥。我們計劃使用10x Genomics的新產品來了解免疫細胞功能缺陷的表觀遺傳和轉錄調控,并在將來利用此信息來設計更精準有效的免疫療法!
西班牙國家基因組分析中心的單細胞基因組學團隊負責人Holger Heyn博士正在研究B細胞分化和激活的機制。他表示:“之前,我們一直依靠計算機預測將細胞的表觀基因組與單細胞基因表達譜相匹配。10x Genomics的多組學分析讓我們能夠直接測定以往只能預測的內容,并且能夠確認這些預測的準確性如何!
西奈山伊坎醫學院的遺傳學和基因組學副教授Panagiotis Roussos博士談到:“通過這項新技術,我們可以更好地了解各種神經精神疾病中的非編碼遺傳變異的作用機制,包括阿爾茨海默病、帕金森病、精神分裂癥、雙相情感障礙和重度抑郁癥!
有了Chromium單細胞多組學ATAC + 基因表達,研究人員能夠:
▪ 通過轉錄和表觀基因組的關聯分析來加深其對細胞類型和狀態的鑒定
▪ 發現轉錄圖譜相似但染色質景觀功能不同的細胞
▪ 探索細胞分化、發育和疾病背后的基因調控相互作用
▪ 使用關鍵的表達標志物來輕松解釋表觀遺傳圖譜
▪ 通過同一細胞的多個讀數,從寶貴樣本中獲得最大量的信息